El nuevo gimnasio de las Escuelas de San Francisco se ubicará en el volumen construido en el patio, como parte de las obras llevadas a cabo en 2018 para instalar en él una cubierta. Los trabajos se han adjudicado a la empresa Erki Construcción Sostenible S.L. por 186.095,05 euros, con un 7,2% de baja respecto al precio de licitación, que fue de 200.522,58 euros. La pieza principal de la cubierta se ejecutó a modo de edificio puente, liberando por completo lo que en altura equivaldría a la planta baja del edificio. Esta pieza se desarrolló con la misma altura que la planta primera, por lo que aun siendo de configuración diferente al resto tanto en forma como en materiales, volumétricamente se conformó como un patio cuadrado.
Se debe actuar, no solo en ese espacio de la cubierta, sino en los dos accesos al mismo y en los dos grupos de aseos situados en la planta primera del lado de la calle San Francisco. Estos aseos verán disminuidos sus aparatos en ambas plantas. En la planta inferior se reducen los aseos ligeramente para permitir el acceso al gimnasio desde circulaciones generales. El aseo de la planta superior se ve reducido en mayor medida, puesto que es necesaria la colocación de una sala de instalaciones para ubicar en ella los elementos de ventilación y calefacción necesarios para el proyecto que se presenta.